ประกาศทบวงมหาวิทยาลัย เรื่องการแบ่งส่วนราชการในมหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ (ฉบับที่ 2) พ.ศ. 2520 ลงวันที่ 19 กันยายน 2520 แบ่งส่วนราชการสำนักงานอธิการบดี เป็น 12 กอง ได้แก่
1. กองกลาง
2. กองการเจ้าหน้าที่
3. กองกิจการนิสิต
4. กองคลัง
5. กองแผนงาน
6. กองธุรการวิทยาเขตปทุมวัน
7. กองธุรการวิทยาเขตพลศึกษา
8. กองธุรการวิทยาเขตบางเขน
9. กองธุรการวิทยาเขตบางแสน
10. กองธุรการวิทยาเขตพิษณุโลก
11. กองธุรการวิทยาเขตมหาสารคาม
12. กองธุรการวิทยาเขตสงขลา
จัดตั้ง หน่วยตรวจสอบภายใน ตามระเบียบการเบิกจ่ายเงินจากคลัง พ.ศ. 2505 โดยมติคณะรัฐมนตรี ที่ สร 0201/ว 78 ลงวันที่ 19 สิงหาคม 2519
พ.ศ. 2524
หน่วยตรวจสอบภายใน
จัดตั้ง กองบริการการศึกษา ตามประกาศทบวงมหาวิทยาลัย (ฉบับที่ 6) พ.ศ. 2526
พ.ศ. 2526
กองบริการการศึกษา
จัดตั้ง กองวิเทศสัมพันธ์ ตามประกาศทบวงมหาวิทยาลัย (ฉบับที่ 6) พ.ศ. 2539
พ.ศ. 2539
กองวิเทศสัมพันธ์
สภามหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ ในการประชุมครั้งที่ 8/2542 วันที่ 15 ตุลาคม พ.ศ. 2542 ได้อนุมัติให้สำนักงานอธิการบดีปรับโครงสร้าง แบ่งหน่วยงานในสังกัดสำนักงานอธิการบดีเป็น 8 กอง 1 หน่วย และ 13 ฝ่าย ได้แก่
กอง : กองกลาง กองกิจการนิสิต กองการเจ้าหน้าที่ กองคลัง กองบริการการศึกษา กองแผนงาน กองวิเทศสัมพันธ์ และกองธุรการองครักษ์
หน่วย : หน่วยตรวจสอบภายใน
ฝ่าย : ฝ่ายจัดการทรัพย์สินและสวัสดิการ ฝ่ายแนะแนวและให้คำปรึกษา ฝ่ายประกันคุณภาพการศึกษา ฝ่ายประชาสัมพันธ์ ฝ่ายพัฒนาบุคลากร ฝ่ายพัสดุกลาง ฝ่ายยานพาหนะและความปลอดภัย ฝ่ายรับนิสิตใหม่ ฝ่ายวินัยและนิติการ ฝ่ายสวัสดิการนิสิต ฝ่ายส่งเสิรมการวิจัย ฝ่ายอาคารสถานที่ และฝ่ายส่งเสิรมกิจการมหาวิทยาลัย
สภามหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ ในการประชุมครั้งที่ 2 / 2547 วันที่ 12 มีนาคม พ.ศ. 2547 ได้อนุมัติให้สำนักงานอธิการบดีปรับโครงสร้าง โดยมีผลบังคับใช้ตั้งแต่วันที่ 1 เมษายน พ.ศ. 2547 ให้แบ่งหน่วยงานออกเป็น 7 กอง 1 หน่วย และ 5 ฝ่าย ได้แก่
หน่วย : หน่วยตรวจสอบภายใน
กอง : กองกลาง กองกิจการนิสิต กองการเจ้าหน้าที่ กองคลัง กองบริการการศึกษา กองแผนงาน และกองวิเทศสัมพันธ์
ฝ่าย : ฝ่ายจัดการทรัพย์สิน ฝ่ายประกันคุณภาพการศึกษา ฝ่ายพัฒนาสถานที่และสิ่งแวดล้อม ฝ่ายยานพาหนะและความปลอดภัย และฝ่ายประชาสัมพันธ์และสารสนเทศ
ตามมติคณะกรรมการบริหารมหาวิทยาลัย ในการประชุมครั้งที่ 9 / 2548 วันที่ 14 กันยายน พ.ศ. 2548 แบ่งเป็น 7 กอง 1 หน่วย และ 3 ฝ่าย โดย 1. รวมฝ่ายพัฒนาสถานที่และสิ่งแวดล้อม และฝ่ายยานพาหนะและความปลอดภัย จัดตั้งเป็น ศูนย์พัฒนาสภาพและกายภาพ จัดการขนส่งและความปลอดภัย และ 2. ยกฐานะฝ่ายประชาสัมพันธ์และสารสนเทศ ขึ้นเป็นศูนย์สารสนเทศและการประชาสัมพันธ์
ในปีการศึกษา 2550 สำนักงานอธิการบดี ประกอบด้วย 7 กอง 1 หน่วย 3 ฝ่าย และ 2 ศูนย์ ได้แก่
หน่วย : หน่วยตรวจสอบภายใน
กอง : กองกลาง กองกิจการนิสิต กองการเจ้าหน้าที่ กองคลัง กองบริการการศึกษา กองแผนงาน และกองวิเทศสัมพันธ์
ฝ่าย : ฝ่ายจัดการทรัพย์สิน ฝ่ายประกันคุณภาพการศึกษา ฝ่ายวิจัย
ศูนย์ : ศูนย์พัฒนาสภาพกายภาพ การจัดการขนส่งและความปลอดภัย และศูนย์สารสนเทศและการประชาสัมพันธ์
ปี 2551 การประชุมคณะกรรมการบริหารมหาวิทยาลัย ครั้งที่ 4 / 2551 วันที่ 8 เมษายน พ.ศ. 2551 มีมติให้มหาวิทยาลัยจัดให้มีการบริหารงานในเชิงยุทธศาสตร์ เพื่อให้สามารถขับเคลื่อนการพัฒนาพันธกิจของการเป็นมหาวิทยาลัยได้อย่างมีเอกภาพ บนพื้นฐานของการใช้ทรัพยากรและบุคลากรร่วมกัน
การบริหารขึ้นตรงต่ออธิการบดี โดยอธิการบดีมอบอำนาจให้รองอธิการบดีฝ่ายบริหารกำกับดูแลการบริหารงานบุคคลและการบริหารงบประมาณ หน่วยงานบางหน่วยงานบริหารงานในเชิงยุทธศาสตร์ ได้แก่ งานรับนิสิตใหม่ กองบริการการศึกษา บริหารงานในรูปแบบศูนย์การประเมินผลและรับนิสิต ขึ้นตรงต่อรองอธิการบดีฝ่ายวิชาการ งานสวัสดิการบุคลากร กองการเจ้าหน้าที่ เป็นศูนย์สวัสดิการบุคลากร บริหารงานในรูปแบบศูนย์การประเมินผลและรับนิสิต ขึ้นตรงต่อรองอธิการบดีฝ่ายพัฒนาศักยภาพนิสิต
พ.ศ. 2551
การบริหารงานในเชิงยุทธศาสตร์
วันที่ 8 เมษายน พ.ศ. 2554 มหาวิทยาลัยได้มีการจัดตั้งสถาบันยุทธศาสตร์ทางปัญญาและวิจัย จึงทำให้การบริหารงานสำนักงานอธิการบดีประกอบด้วย 7 กอง 2 ฝ่าย และ 1 หน่วย ได้แก่
กอง : กองกลาง กองกิจการนิสิต กองการเจ้าหน้าที่ กองคลัง กองบริการการศึกษา กองแผนงาน และกองวิเทศสัมพันธ์
ฝ่าย : ฝ่ายจัดการทรัพย์สิน และฝ่ายประกันคุณภาพการศึกษา
หน่วย : หน่วยตรวจสอบภายใน
พ.ศ. 2554
สถาบันยุทธศาสตร์ทางปัญญาและวิจัย